Сергей Алексеевич Пономарев родился в крестьянской семье. Отец-крестьянин и мать-домохозяйка.Отец занимался сельским хозяйством до Октябрьской революции. Окончил 5 классов в 1921 году. С 1926 года Сергей Алексеевич начал самостоятельную работу на сельском хозяйстве отца. С 1930-1932 года проходил срочную службу в рядах Рабоче-крестьянской Красной Армии. После демобилизации работал в органах ОГПУ и НКВД СССР, служил участковым уполномоченным Жлобинского райотдела милиции.С 6 сентября 1939 года по 15 января 1940 года находился в командировке в Белорусском особом военном округе. Участвовал в операции по присвоению территории Западной Беларуси к СССР. Воевал на Западном фронте и в начале сентября 1941 года был ранен. С февраля 1942 года сражался на северо-западном фронте. После окончания ВОВ Сергей Алексеевич продолжил службу в вооружённых силах СССР до 1946 года.После увольнения в запас вернулся на работу в органы МВД СССР. В отставку вышел в 1956 году в звании майора.