Начало войны Андрей Игнатьевич встретил в деревне Речень. Прошел мобилизацию и был отправлен на фронт, но формирование было разбито наступающими немецкими войсками под Слуцком. Анисов Андрей Игнатьевич вернулся назад в родное село и находился там до начала партизанского движения. В 1943 году вступил в партизанский отряд имени Александра Невского, которым командовал Плышевский. В составе отряда участвовал в многочисленных походах, операциях, боях, минировал дороги, ходил в засады. Весной 1944 года был призван в Красную Армию. Под Брестом Андрей Игнатьевич был зачислен в 234 артиллерийский полк, которым командовал подполковник Роскошный. Был назначен связистом. Форсировал реку Буг, участвовал в боях за Варшаву. Был отправлен на Прусскую границу. Участвовал в боях за Кёнигсберг, Берлин. Закончил войну в Чехословакии под Прагой.