В 1941 г. был призван Краснопольским РВК в Красную Армию. На фронтах Отечественной войны - с 23 июня 1941 г. Сначала воевал на Западном фронте, а с 1 июля 1944 - на 1-м Беорусском фронте. Дважды был ранен. За самоотверженость в бою по содействию в форсировании реки Висла и прорыве обороны противника на левом берегу гвардии старший лейтенант Ф. Т. Сидоренко 6 августа 1944 командованием 102-го гвардейского стрелкового полка был представлен к провительственной награде "Герой Советского Союза" Однако высокого звания Ст. лейтенант Ф. Т. Сидоренко не получил. Он был награжден высшей наградой СССР - орденом Ленина. Однако об этом не узнал, так как наградной лист был оформлен 6 августа, а 10 августа 1944 года ст. лейтенант, заместитель командира по страевой части Филипп Тимофеевич Сидоренко был убит и похоронен в Польше.