В июле 1942 года был призван на службу в Рабоче-крестьянскую Красную армию. С декабря 1943 года — на фронтах Великой Отечественной войны. К июлю 1944 года сержант Виктор Афанасьев командовал отделением взвода пешей разведки 609-го стрелкового полка 139-й стрелковой дивизии 50-й армии 2-го Белорусского фронта. Отличился во время форсирования реки Неман . 15 июля 1944 года, несмотря на сильный огонь противника, Афанасьев вместе с группой из шести бойцов переплыл реку Неман в районе деревни Ковши к юго-востоку от Гродно и закрепился на её левом берегу. Участвовал в отражении контратак немецких войск и удержании захваченного плацдарма. Был ранен, но поля боя не покинул.